故事讲述了医圣王波在被人陷害入狱后，重获自由并展开复仇的经历。出狱后的王波回到云京，先是覆灭了徐家，随后揭露并挫败了沈家勾结倭寇入侵的阴谋。在这场复仇之路上，王波以非凡的智慧和医术逐渐获得了地位和尊严，并成功揭开了隐藏在背后的复杂阴谋。剧情充满了反转与**，王波不仅面对外敌的挑战，更要面对内心的挣扎与成长。